En MongoDB los documentos se almacenan en BSON, que es una estructura JSON en formato binario.

MongoDB, proporciona por un lado un lenguaje de consulta propio que se ejecuta en shell (VER TUTORIAL CON EJEMPLOS) y por otro proporciona APIs y drivers para gran cantidad de lenguajes de programación actuales, facilitando su uso sea cual sea el lenguaje que utilice el programa cliente que desea acceder a los datos.